Die Domschule übernimmt auf Grund rechtlicher und personeller Verbindung dauerhafte Aufgaben in der Diözese Würzburg und für die Kirche in Deutschland. Zugleich werden einzelne Mitarbeitenden mit besonderen Aufgaben vertraut: Mitarbeit in der Bildung vor Ort, in der Ehevorbereitung und dem überdiözesanen Aufgabenbereich Theologie im Fernkurs. Das Netzwerk Moraltheologie hat seinen Ort in der Akademie des Bistums.